Genderdysforie is een gevoel van lijden of stress dat iemand kan ervaren als de genderidentiteit niet overeenkomt met het toegewezen geslacht bij de geboorte. 

• Niet elke trans persoon ervaart genderdysforie.
• Genderdysforie is de tegenhanger van gendereuforie.
• Het wordt vaak als synoniem gebruikt voor genderincongruentie, maar beide begrippen verschillen subtiel van elkaar. Genderdysforie benadrukt het lijden en de stress die komt kijken bij het gebrek aan overeenkomst tussen het toegewezen geboortegeslacht en de genderidentiteit. Niet elke persoon die genderincongruentie ervaart, lijdt hier onder.   
• Zowel genderdsyforie als genderincongruentie worden vaak als diagnose gebruikt binnen transgenderzorg. De reden om dit als diagnosetermen (wel niet langer als mentale stoornis, maar als een gezondheidsgerelateerde conditie) op te nemen, is om de terugbetaling van transgenderzorg te waarborgen.